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市场人士认为，未来新三板的独立性将继续增强。
2016年首周，受到A股市场大幅回落影响，新三板两大指数——三板做市指数和三板成指上周双双大幅下挫，全周分别下跌4.59%和4.43%，双双刷新了阶段最大单周跌幅，个股也是涨少跌多。未来随着股权投资爆发、制度红利释放、估值低企、挂牌数量增多等积极因素的持续发酵，新三板中长期呈螺旋式上升趋势并未改变，但个股之间的分化也将日益显著。
受累联动性新三板大幅回落
受到新年首周A股市场大幅下挫的拖累，三板做市指数和三板成指上周双双由升转跌，并创下了阶段最大跌幅，不过量能依旧维持在相对高位水平，交投依然较为活跃。市场人士认为，未来新三板的独立性将继续增强。
上周A股市场创下历史以来首周最差成绩，受此影响，新三板两大指数上周也纷纷由涨转跌。三板成指在连续三周上涨后，上周下跌4.43%，收报1418.79点，跌破5日及10日两条短期周均线位置，并创下了2015年7月首周以来的最大周跌幅。三板做市指数上周也大跌4.59%，收于1372.01点，失守20日周均线，并刷新了2015年8月最后一周以来的最大周跌幅。
虽然指数表现不佳，但新三板整体成交依然维持活跃。上周新三板合计成交10.87亿股，成交金额为31.02亿元，与前两周一同维持在相对高位区间。其中，做市转让股上周成交5.49亿股，成交额为31.02亿元；协议转让股则成交了53.87亿股，合计成交20.21亿元。
上周共有1306只新三板股票出现成交，其中有12只股票的周成交额在5000万元以上，卫东环保、明利仓储、联讯证券 、华强文化、津同仁堂和鑫荣基的周成交额更是超过了1亿元，具体成交金额分别为4.81亿元、3.13亿元、2.77亿元、2.59亿元、1.28亿元和1.02亿元。
上周上涨的366只新三板股票中，有27只股票实现翻倍。其中，赢鼎教育、德生防水和三金科技上周涨幅均超过了10倍，具体涨幅分别为39503.96%、3475.00%和1198.57%，紧随其后的麦韬之星、浩淼科技、普康迪、淳中科技、国佳新材和三达奥克的周涨幅也均在300%之上。上周新三板共有793只股票下跌，可视化、灵鸽科技和诺思兰德周跌幅超过90%，分别下跌96.15%、93.38%和90.74%，中矿华沃、京西创业和麦高金服的跌幅也均在80%以上。
民生证券指出，去年股灾期间，新三板两大指数受到A股的影响显著，三板做市在去年7月7日曾创下12.15%的单日最大跌幅，而1月4日的“双跌”，也再次反映出新三板市场的独立性仍然不够完备，受到A股的连带效应仍然明显。不过随着分层、公募基金入市以及转板制度的推出，新三板的独立性将逐步确立。
联讯证券则表示，虽然三板做市指数受主板影响，但跌幅却显著小于主板指数，这主要是因为，首先，新三板现在挂牌制度已类似于注册制，因而对供需关系不会产生过大的影响；其次，没有大股东减持的压力；再次，新三板挂牌企业虽然是中小微企业但净资产收益率较高，并且所属行业比主板行业景气度较高；最后，新三板市盈率低于创业板市盈率，安全边际稍高。
新三板未来分化料加剧
自全国中小企业股份转让系统2013年1月16日正式揭牌运营以来，发展十分迅猛。相关数据显示，当时的挂牌公司仅有200家左右，总市值约336亿元；2014年底，挂牌公司达1372家，总市值达2265亿元。而截至1月8日，来自东方财富 Choice数据显示，新三板挂牌公司达到了5259家，总市值则达1.72万亿元。两年不到的时间内，新三板挂牌数涨了26倍，总市值增加了50倍以上。有业内人士认为，在股权投资爆发、制度红利释放、估值低企、挂牌数量增多等积极因素下，新三板中长期将呈螺旋式上升，2016年仍是布局新三板优质品种的最好时机。不过未来个股之间的分化也将日益显著。
中泰证券就表示，新三板市场总体来说仍处于低位徘徊，这是暴风雨前的平静，分化节点将至。目前各家经营尚好的公司已经迫不及待的公告业绩预告 ，因分层需要可以预期到新三板市场整体年报必将让人惊艳。但根据创业板经验，新三板市场2016年必将是分化之年，在注册制开放背景下有转板预期的优质企业必将强者恒强，公募与保险等低风险偏好生力军必将优先偏斜此类龙头企业。而部分公司的业绩承诺与规划蓝图也会逐步被证伪，将面临成长与估值的“双杀”。
国都证券也指出，预计2016年新三板政策红利将进一步释放，分层率先落实之后，退市 、转板、公募基金、做市商制度等将进一步完善，并购重组频发、监管趋严将成为大概率事件，未来市场将会进一步分化，建议投资者关注受益于分层制度和IPO概念的优质标的。
